O IHT é constituída por:
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Colegiado e Comissões Especializadas: Comissão de Orçamento e Finanças; Comissão de Espaço; Comissão de Pessoal; Comissão Avaliadora Local
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Direção do IHT
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Departamento de História
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Programa de Pós-Graduação em História (Stricto Sensu)
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Coordenação do Curso de Pós-Graduação em Ensino de História (Mestrado Profissional)
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Coordenação do Curso de Graduação em História (Licenciatura e Bacharelado)