O estágio de pós-doutorado no PPGH tem como objetivos principais receber pesquisadores-doutores para desenvolvimento de atividades de pesquisa e interlocução acadêmica junto ao Programa.. Diferencia-se das categorias de mestrado e de doutorado, por ser proposto por um docente ao colegiado do PPGH, que assume a supervisão da pesquisa e a responsabilidade de incorporar o pesquisador às atividades acadêmicas do laboratório ou núcleo de pesquisa. Há duas categorias de estágio associadas ao tempo de titulação do solicitante, a saber: Pós-doutorado Junior e Pós-doutorado Senior. Em ambos os casos, a proposta deverá ser encaminhada pelo supervisor de pós-doutoramento à comissão de planejamento (CPLAN) do PPGH.